第9回IPABシンポジウム IPAB2008 / AHeDD2008合同シンポジウム
～創薬・ゲノム・医療情報処理のアクセラレーション～
日時 ： 2008年10月16日（木）～17日（金）
場所 ： SGIホール（恵比寿）
主催： 特定非営利活動法人 並列生物情報処理イニシアティブ（IPAB）
AHeDD 2008実行委員会
協賛法人： 東京工業大学グローバルCOE「計算世界観の深化と展開」
エヌビディア ジャパン
株式会社 エルザ ジャパン
株式会社フィックスターズ
株式会社情報数理研究所
株式会社ベストシステムズ
日本アイ・ビー・エム株式会社
ClearSpeed Technology, Inc.
協賛学会等： 日本バイオインフォマティクス学会
情報計算科学生物学会
日本医療情報学会
人工知能学会
情報処理学会（バイオ情報学研究会,数理モデル化と問題解決研究会,ハイパフォーマンスコンピューティング研究会）
Bioinformatics and Molecular Design Research Center (BMDRC), Korea
Drug Discovery and Design Center (DDDC), China
第１日： 10月16日（木） “IPABの新展開”
10:00-10:05 開会のご挨拶 秋山 泰 （IPAB理事長 / 東京工業大学）
10:05-11:45 セッション１: アクセラレータ技術
企画: 小西史一 （IPAB副理事長，アクセラレータWG主査 / 東京工業大学
10:05-10:35 佐貫俊幸 （日本アイ・ビー・エム（株） 技術理事）
“ペタ・スケール・コンピューティングに向けての挑戦”
10:35-11:05 田村陽介 （（株）フィックスターズ CTO）
“Cell/B.E.におけるソフトウェア開発の現状と応用事例”
11:05-11:35 橋本昌嗣 （日本SGI（株） CTO）
“GPUコンピューティングの可能性”
11:35-11:45 小西史一 （東京工業大学）
“IPABにおけるアクセラレータWG活動の紹介”
11:45-13:00 ～昼休み 企業によるランチョンセミナー（参加無料） 企業展示など ～
13:00-13:50 特別講演 萩原兼一 （大阪大学 大学院情報科学研究科）
“GPGPUによる医用画像処理について”
13:50-15:20 セッション２: 医療情報学
企画: 日紫喜光良 （IPAB理事，医療情報学WG主査 /
13:50-14:20 日紫喜光良 （東邦大学 理学部情報科学科）
“IPABにおける医療情報学への取り組み”
14:20-14:50 鈴木 穣 （東京大学 大学院新領域創成科学研究科）
“次世代シークエンサーを用いた完全長cDNAの解析”
14:50-15:20 水島 洋 （東京医科歯科大学 大学院疾患生命科学研究部）
“診療情報と分子情報の網羅的データベース（iCOD）の構築”
15:20-16:00 ～コーヒーブレイク 企業展示、および学術ポスター展示～
16:00-17:30 セッション３：創薬情報学とAHeDD
企画: 秋山 泰 （IPAB理事長，創薬情報学WG主査 / 東京工業大学）
16:00-16:30 Prof. Kyoung Tai No (Yonsei University / BMDRC, Korea)
“Development of e-Organ and It's Application for Drug Repositioning”
16:30-17:00 広川貴次 （産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター）
“活性部位形状フィンガープリントを用いたバーチャルスクリーニング”
17:00-17:30 Prof. Weiliang Zhu (DDDC, SIMM, China)
“Exploring Functional Conformations of Target Protein for Drug Discovery by Molecular Dynamics”
Day,2nd：October 17th (Fri),2008 “Asia Hub for e-Drug Discovery”
10:30-10:45 Introduction to AHeDD activity
Prof. Kyoung Tai No (Yonsei University / BMDRC, Korea)
Prof. Weiliang Zhu (DDDC, SIMM, China)
Prof. Yutaka Akiyama (Tokyo Tech, Japan)
10:45-12:15 Session 4: Frontiers of Drug Discovery Research
Chair: Prof. Kyong Tai No (Yonsei University / BMDRC, Korea)
10:45-11:15 Dr. Sungchul Chung (STEPI, Korea)
“Opportunities for S&T Cooperation in East Asia”
11:15-11:45 Prof. Yun Tang (East China Univ. of Science and Technology, China)
“New potential inhibitor binding sites identified in HIV-1 integrase”
11:45-12:15 Dr. Tohru Natsume (BIRC, AIST, Japan)
“Systematic Analysis of Protein Interaction Networks”
12:15-13:30 Lunch Break
*Commercial Exhibitions, and Poster Display
13:30-14:20 Special Talk
Prof. Toshihisa Ishikawa (Tokyo Tech, Japan)
“Transporter mechanism-based drug molecular design: High-speed screening, QSAR analysis, and molecular orbital calculation”
14:20-15:50 Session 5: Challenges for Important Targets
Chair: Prof. Weiliang Zhu (DDDC, SIMM, China)
14:20-14:50 Prof. Hong Gil Nam (POSTECH, Korea)
“Molecule-Level Imaging of Pax6 mRNA Distribution in Mouse Embryonic Neocortex by Molecular Interaction Force Microscopy”
14:50-15:20 Prof. Baik-Lin Seong (Yonsei University, Korea)
“Common Vaccine Platform for Seasonal and Pandemic Influenza”
15:20-15:50 Dr. Tomoko Niwa (Nippon Shinyaku Co., Ltd., Japan)
“Elucidation of Characteristic Structural Features of Protein Kinases: A Neural Network Approach”
15:50-16:30 Poster Presentation Time
Explanation by authors. With Coffee service.
16:30-18:00 Session 6: Novel Computing Techniques for Drug Design
Chair: Prof. Hiroshi Chuman (The University of Tokushima, Japan)
16:30-17:00 Prof. Jianfeng Pei (Peking University)
“De novo drug design - to be a more practical approach
17:00-17:30 Dr. Kunqian Yu (DDDC, SIMM, China)
"Drug discovery Grid of China”
17:30-18:00 Dr. Toshio Watanabe (RICS, AIST)
"Molecular Orbital Calculation for Large Molecule with Sakurai-Sugiura Method on Grid Computing Environment”
18:00 ～Closing Remark～
